Sudah 1 tahun sejak Merge terjadi.
Pulau NINJAGO® awalnya berdiri sendiri di Laut Tak Berujung, hanya terhubung dengan sihir ke alam mitos dan legenda yang jauh. Lalu, Merge pun terjadi. Peristiwa misterius ini tiba-tiba membuat semua alam ini menjadi satu, mengubah Pulau NINJAGO menjadi satu benua di planet yang penuh dengan petualangan, kekuatan, misteri, dan ... oh ya ... naga! Sayangnya, pasukan kejahatan berencana menggunakan kekuatan naga untuk menghancurkan dunia baru itu. Bisakah para ninja menyelamatkan dunia? Sayangnya ....
Merge juga merupakan saat semua ninja menghilang selamanya. Atau begitulah tampaknya ....